مجله علوم کشاورزی ایران

مجله علوم کشاورزی ایران

طبقه بندی ژنتیکی گندمهای ایران با استفاده از الکتروفورز پروتئینها (SDS-PAGE) ‘لیزر اسکانر دنسیتومتری (LSD) وتجزیه ای خوشه ای

نویسندگان
علی مسعودی نژاد
بهمن یزدی صمدی
سیروس عبد میشانی
محمد نبی سربلوکی
چکیده
الگوی پروتئینهای تفکیک شده بر روی ژل منعکس کننده ژنوم ارقام بوده ولذا می تواند به عنوان یک صفت و روش جهت طبقه بندی و شناسایی ارقام استفاده شود. در این مطالعه تعدادی از گندمهای ایران انتخاب و پس از انجام الکتوفورز (SDS-PADE) برای پروتئین ذخیرهای آندوسپرم (گلوتنین) ‘ از پروفیل مربوط به کلیه باندهای هر نمونه (w-Gliadin,HMW-GluteninوLME-Glutenin) با استفاده از دستگاه لیزر اسکاتر منحنی هایی بدست آمد. جهت طبقه بندی از روش آماری تجزیه خوشه ای استفاده شد. صفات مورد مطالعه‘ ژنوتیپ ا زنقطه نظر آللهای HMW-GS و سطوح زیرمنحنی ناحیه های مختلف پروفیل الکتروفورزی بودند . درصد تشابه با استفاده از ضرایب همبستگی پیرسون ‘ کانیرا‘ وینستین و فاصله اقلیدسی محاسبه گردید. بر اساس ماتریس تشابه یا فاصله ‘ دندروگرام رسم گردید و ژنوتیپهای گروهبندی شدند. برای مکانهای ژنی کنترل کننده HMW-Glutenin از روشهای مختلف تجزیه خوشه ای (UPGMA,SL.CL.WPGMA)استفاده شد. که مناسبترین نتایج با روش UPGMA بدست آمد.
کلیدواژه‌ها
الکتروفورز
تجزیه خوشه ای
تنوع ژنتیکی
دنسیتومتری
گلوتنین
گندم
لیزر